rsync voisi hoitaa homman, edellyttäen, että kopioit tiedostot vain yhteen paikkaan uudella levyllä. rsyncin pitäisi osata oikeilla vivuilla erottaa uudempi tiedosto vanhemmasta ja skipata (tai poistaa jos haluaa) vanha tiedosto.
Tosin joutuisit käymään jokaisen hakemiston yksitellen läpi. Krsync on GUI tolle jos haluaa tehdä sillä.
Voi olla helpompiakin tapoja, mutta tuo tuli nyt ensimmäisenä mieleen.
Kannattaa kokeilla muutamalla tiedostolla ennen kun lähtee tekee isompaa muutosta.